延续前一集的剧情，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 配音）以及企鹅们，为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约，对一架破旧的失事飞机进行维修改造，并成功起飞。当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时，飞机却意外降落，迫降到了非洲大草原上......

秋菊从梅县逃往香港，找她在香港唯一的朋友。谁料，因秋菊有点姿色，竟被骗出卖肉体，幸好及时逃脱，遇上了一起逃往香港的阿妹姐。秋菊被介绍清洁女工，偶然认识了酒店董事，秋菊从此飞上枝头变凤凰。本故事以秋菊逃往香港后，她及她身旁的人所受之遭遇，揭露出香港社会之人欲横流……